英文标题:Diverging cellwall strategies for drought adaptation in two maize inbreds with contrasting lodging resistance期刊名字:Plant,Cell & EnvironmentDOI:https://doi.org/10.1111/pce.14822本研究以B73(抗茎秆倒伏)和EA2024(易茎秆倒伏)两份性状迥异的玉米自交系为试验材料,探究干旱胁迫下二者细胞壁重塑的差异化调控策略,解析玉米抗倒伏与抗旱性状之间的内在关联。表型与生理测定结果表明,抗倒伏自交系B73耐旱性显著弱于易倒伏自交系EA2024,干旱复水后B73无法存活,而EA2024可恢复正常生长。EA2024天然拥有更高纤维素、对香豆酸含量,保水能力更强。细胞壁组分分析显示,干旱促使EA2024木质素含量下降、阿拉伯聚糖与阿拉伯半乳聚糖等亲水多糖积累。B73则维持木质素总量不变,但木质素H单体减少、S单体及S/G比值上升,糖醛酸含量大幅提升,细胞壁重构程度更剧烈。转录组数据分析发现,干旱对B73基因表达的影响范围更广,细胞壁相关基因的表达模式存在明显自交系特异性,尤其木质素合成通路基因分化最为显著,PAL、C4H、CAD等关键基因表达差异直接造成木质素组分改变。研究还通过免疫检测明确了两类玉米果胶、半纤维素的结构变化规律,并筛选出MYB、WRKY、ABI等参与干旱应答的特异性转录因子及其调控网络。综合分析证实,B73为适配抗倒伏性状形成了刚性强、可塑性低的细胞壁结构,进而削弱了干旱适应能力;而EA2024细胞壁可塑性高,更易通过组分重塑抵御干旱。该研究阐明了玉米抗倒伏与抗旱的拮抗关系,为培育兼具抗倒伏、抗旱特性的玉米新品种提供了理论依据与候选基因资源。2.样本处理
本研究分多组样本开展培育与检测。玉米自交系B73、EA2024分环境培育:转录组材料于气候箱培养至三叶,分别干旱7、9、10d。生理与细胞壁样品温室干旱10d。另设25d重度干旱复水试验,各组均混合5株地上组织,2个生物学重复。生理叶片测定鲜重、膨重、干重计算相对含水量,使用光合仪检测气体交换指标。茎秆粉末经甲醇浸提得到细胞壁醇不溶残渣,依次用CDTA、稀碱、浓碱分级提取果胶与半纤维素组分,通过GC、HPLC、免疫斑点检测木质素、多糖、酚类物质,每项3次技术重复。不同干旱时间点植株提取总RNA,构建双端测序文库,数据比对玉米参考基因组;利用DESeq2筛选差异基因,maSigPro分析时序表达,qRT-PCR验证基因,以LUG为内参。最后整合差异细胞壁基因做转录因子富集,借助软件构建基因型特异调控网络,完整配套多维度样本前处理与分子检测流程。
3.研究结果
①B73与EA2024对干旱胁迫的表型响应态
将B73、EA2024玉米幼苗培养至三叶期,停水10d进行干旱处理。宏观表型观察显示:干旱对B73损伤程度远高于EA2024(图1)。处理10d后测定叶片相对含水量(RWC),无论正常供水还是干旱条件,EA2024叶片保水能力均优于B73。
测定气体交换与叶绿素荧光参数评估植株光合性能,正常供水下,两份自交系PSII实际光化学效率(ΦPSII)、电子传递速率(ETR)、CO2同化速率(A)、胞间CO₂浓度(Ci)无显著差异;但EA2024蒸腾速率(E)显著低于B73。干旱后,EA2024胞间CO₂浓度上升,B73无明显变化。停水25d后复水,检验极端干旱后植株恢复能力:B73全部死亡,EA2024复水1周后完全恢复正常生长表型(图1)。
综上,生理表型结果为茎秆抗倒伏自交系B73干旱敏感,茎秆易倒伏自交系EA2024干旱耐受性更强,二者干旱生理响应存在本质差异。
图1.B73和EA2024在干旱下表现出的表型变化。
②干旱对B73、EA2024细胞壁重塑的影响
研究测定干旱处理10d植株茎秆木质素、多糖含量。采用克拉森法测定木质素总量,硫代酸解-气相色谱质谱联用解析木质素单体组分。结果显示,干旱不改变B73木质素总量,但EA2024茎木质素含量下降20%(图2)。反之,干旱不改变EA2024木质素单体组成,B73则出现H单体减少、S单体与S/G比值上升(图2)。两份自交系经硫代酸解释放的H、G、S单体总量均上升,说明干旱会降低木质素聚合程度。
图2.B73和EA2024在对照和干旱条件下的木质素含量和组成。
细胞壁多糖结果为,正常供水下EA2024纤维素含量高于B73。干旱后两份自交系纤维素含量均上升10%(图3)。总半纤维素在两份自交系中含量相近、不受干旱影响;干旱后EA2024细胞壁葡萄糖含量上升60%,B73糖醛酸含量上升60%(图3)。本研究同时定量细胞壁酯键连接羟基肉桂酸(图4),正常供水下EA2024酯化对香豆酸含量高于B73,干旱无显著改变;两份自交系酯化阿魏酸、交联二阿魏酸含量相近,干旱无显著变化。干旱仅小幅但显著提升EA2024阿魏酸/对香豆酸比值(图4)。
图3.在控制和干旱条件下培养的B73和EA2024的细胞壁多糖组成。
图4.B73和EA2024在对照和干旱条件下生长的植物细胞壁羟基肉桂酸组成。
对细胞壁分级提取,区分钙离子桥联果胶(CDTA组分)、弱交联半纤维素(KI组分)、强交联半纤维素(KII组分),探究干旱对多糖分布的影响(图5)。B73遭遇干旱后KII组分总糖(可提取半纤维素)上升,CDTA、KI组分无变化,KII/KI比值升高。EA2024仅CDTA果胶含量小幅下降,半纤维素分配无变化。两份自交系糖醛酸含量、分布对干旱响应存在差异(图5)。正常供水下EA2024交联糖醛酸总量高于B73,但CDTA可溶性糖醛酸含量低于B73(图3、图5)。干旱后EA2024 CDTA组分糖醛酸上升,B73该组分糖醛酸下降;B73糖醛酸最显著变化出现在KI、KII组分,分别上升1.5倍、3.5倍(图5)。
图5.来自B73和EA2024的细胞壁半纤维素组分在正常和干旱条件下的总糖含量。
采用完整免疫斑点检测(IDA)与热图分析表征CDTA、KI、KII组分细胞壁多糖精细结构(图6)。干旱条件下,相较于对照组,B73 KI组分低甲酯化同型半乳糖醛酸(HG,JIM5抗体识别)增多,RG-I阿拉伯聚糖侧链(LM6抗体识别)减少。KII组分RG-I阿拉伯聚糖侧链减少、半乳聚糖侧链(LM5抗体识别)增多。
EA2024细胞壁干旱重塑幅度高于B73。CDTA组分低甲酯化HG含量上升。KI组分低甲酯化HG下降,同时部分甲酯化HG、阿拉伯半乳聚糖蛋白、非岩藻糖基木葡聚糖含量上升。KII组分RG阿拉伯聚糖侧链含量上升。综上,干旱改变两份自交系三类细胞壁组分,但EA2024 KI组分变化最为剧烈。
图6.细胞壁表位免疫检测的热图。
③干旱诱导细胞壁相关基因(CWGs)表达变化
本研究选取停水7、9、10天取样进行RNA双端转录组测序,序列比对至B73参考基因组后采用DESeq2筛选差异基因(log₂|FC|>1且校正P<0.05),主成分分析显示94%变异由两因子解释(自交系固有差异PC1占66%,干旱响应差异PC2占28%)。全基因组尺度下干旱分别调控B73的29%和EA2024的21%基因;针对整理的1485个细胞壁相关基因(涵盖纤维素、半纤维素、果胶、膜/细胞壁蛋白、木质素、木栓质、胼胝质、蛋白酶及转录因子编码基因),干旱调控B73中44%、EA2024中31%细胞壁基因,均高于全基因组调控水平。韦恩分析显示下调趋势更显著:B73下调513个(34.5%)、EA2024下调358个(24.1%),其中311个同步下调;上调方面B73为137个(9.2%)、EA2024为106个(7.1%),62个同步上调。另有8个细胞壁基因在两自交系中响应方向完全相反,包括B73上调而EA2024下调的C4Hb(肉桂酸4-羟化酶)与蔗糖合成酶,以及B73下调而EA2024上调的3个过氧化物酶(参与木质素合成/活性氧生成)、1个果胶降解多聚半乳糖醛酸酶、1个糖基转移酶14及1个金属内蛋白酶。
图7.在全基因组和细胞壁基因目录中,干旱10天后基因表达变化的百分比及细胞壁基因的维恩图分布。
本研究将细胞壁基因(CWGs)分为纤维素/半纤维素生物合成、果胶生物合成、膜结合与细胞壁蛋白(MB/CWP)、木质素生物合成及木栓质/胼胝质沉积五类,每类约50%基因受干旱影响,其中木质素类比例最高(55%)。按自交系影响模式可分为两类:C/HC和木质素类中仅单自交系受影响基因占多数,如C/HC类别中仅B73受影响的90个基因超过两系共有的83个基因,木质素类64个仅B73受影响/30个仅EA2024受影响也呈现类似模式(图8,9)。而果胶、MB/CWP等其他类别的DEGs主要在两系中共现。具体来看,纤维素生物合成中大多数纤维素合酶A(CesA)基因在两系中均被下调,仅B73的CesA2被上调;半纤维素方面糖基转移酶(GT)家族响应差异显著,EA2024中9个差异GT基因有6个上调而B73无变化,另一组GT基因则仅在B73差异调控(10上调/24抑制)。果胶相关基因在B73中受影响更大,而G/GalT家族受影响基因数则在EA2024中更多;MB/CWP蛋白中B73受影响基因数量始终高于EA2024。木栓质生物合成中多种GELPs酯酶在两系均被抑制。木质素途径差异最为明显(图10),B73中三种PAL被抑制且C4Hb、C3H/APX及O-甲基转移酶被诱导,提示对羟基香豆酸向阿魏酸代谢流增加,而EA2024中三种PAL被诱导(PAL2为其PTAL同源物)。三种过氧化物酶更是呈现相反响应(B73抑制/EA2024诱导)。这些结果表明干旱通过品系特异性机制调控细胞壁合成与修饰通路,其中参与纤维素、半纤维素和木质素合成的基因主要在B73中受干旱影响,而其他类别基因在两系间反应较相似。
图8.细胞壁基因(CWGs)的表达受10天干旱影响。
图9.B73/EA2024中受干旱影响的基因在功能性CWG类别中的分布。
图10.玉米木质素生物合成途径的示意图。
⑤B73与EA2024细胞壁基因时序表达动态
采用maSigPro包(R>0.6)分析7、9、10d干旱时序细胞壁基因表达,1485个细胞壁基因中1000个被分为9个表达簇。簇1、2为非自交依赖型,簇1(160个)两份同步下调、时序一致。簇2(152个)两份同步上调、时序一致。簇3–9为自交依赖型:基因本底丰度、干旱诱导趋势两份自交系存在差异。不同功能类群自交依赖型基因占比不同:木质素基因81.5%为自交依赖型;膜细胞壁蛋白仅59.6%为自交依赖型;纤维素半纤维素、果胶、木栓胼胝质介于二者之间(图11)。
图11.B73和EA2024植物在对照条件下或经历7、9和10天干旱处理下的细胞壁基因表达谱。
⑥自交系特异性调控细胞壁基因的转录因子鉴定
基于两份自交系7、9、10d干旱差异细胞壁基因,在PlantRegMap平台完成转录因子富集分析,利用Cytoscape绘制调控网络,筛选28个高显著性自交系特异性转录因子。12个归为4个B73特异性子簇(图12),16个归为5个EA2024特异性子簇。多数子簇包含全部类别细胞壁基因,但子簇9(EA2024特异)、子簇43(B73特异)富集纤维素、半纤维素合成基因;子簇9全部为WRKY转录因子,B73特异子簇40、41、42分别为MYB、IDD、ABI家族。
3类调控苯丙烷通路的转录因子存在自交特异性:B73特异子簇42的P1(黄酮调控)、子簇40 MYB19(拟南芥、玉米苯丙烷通路激活因子)。EA2024特异子簇6 MYB31(脱落酸依赖干旱响应调控)。另有5个参与脱落酸信号的转录因子:B73特异ABI3/VP1、ABI19、MYB162。EA2024特异GBF1、HB128。PIF3、MYBST1(EA2024特异)同源基因受生物钟调控。综上,转录因子富集与调控网络分析鉴定出多套自交系特异性转录因子,可调控细胞壁基因表达。
图12.B73和EA2024自交系中特异性的转录因子和CWG调控网络。
4.结论
本研究以抗倒伏B7、易倒伏EA2024两份玉米自交系为材料,解析干旱下细胞壁差异化适应机制。生理层面,EA2024保水能力更强,干旱后可完全复水恢复,B73干旱致死,证明抗倒伏基因型耐旱性更弱。生化结果显示,正常供水EA2024纤维素、对香豆酸、糖醛酸含量更高。干旱后EA2024木质素下降,富集阿拉伯糖果胶与阿拉伯半乳聚糖蛋白。B73木质素S单体、S/G比值上升,半纤维素糖醛酸大幅积累,细胞壁重构程度更深。转录组表明干旱对B73基因扰动更强,44%细胞壁基因差异表达,显著高于EA2024的31%。木质素、纤维素合成基因存在极强基因型特异性,8个关键基因二者干旱表达趋势完全相反。时序聚类显示超80%木质素基因存在自交依赖表达模式。转录因子筛选得到MYB、WRKY、ABI等基因型特异调控因子,分别调控两条细胞壁通路。B73为实现茎秆刚性提升、获得抗倒伏特性,牺牲了细胞壁可塑性,面对干旱需剧烈重塑细胞壁。EA2024细胞壁结构灵活,依靠高阿拉伯糖果胶维持水分,耐旱性更优。研究挖掘的细胞壁基因与转录因子,可用于培育兼顾抗倒伏与耐旱的玉米新材料。